Wako Phos-tag-用于磷酸化蛋白分析使用问题与解答
1. Phos-tag® Acrylamide的溶解
5mmmol/ Phos-tag® 液体 (3v/v% 甲醇):
1) 10mg Phos-tag® Acrylamide 里加入 0.1mL 甲醇
2) 使用枪头搅拌混合直至完全溶解。
3) 加3.2mL 蒸馏水, 用枪头混匀。
2-8℃避光保存。不适合零度以下保存。建议保存时间6个月。
注意:避免溶解过程出现白色悬浮颗粒。
2. α-Casein, from Bovine Milk, Dephosphorylated(038-23221),阳性对照(含有磷酸化和非磷酸化
α-Casein),如何使用?
用水或者上样buffer溶解。用水溶解后,冷冻保存。电泳条件:Phos-tag® 50umol/L,分离胶浓度 10%。
电流:30mM,1小时。
3. 用Alkaline Phosphatase(for Biochemistry)(018-10693)进行磷酸化蛋白的去磷酸化反应体系。
37℃,过夜。# 10 mg/mL phosphorylated protein 50 μL
# 0.50 M Tris/HCl buffer (pH 9.0) containing 0.10 M MgCl2 10 μL
# Sterilized water 39 μL
# Alkaline phosphatase(018-10693). 0.3 unit / 1 μL有一点需要注意:ALP活性化使用Mg离子,相
同的非磷酸化蛋白质用ALP处理的样品的条带和没有用ALP处理的样品的条带的位置不同。
4. Phos-tag® SDS-PAGE实验没有成功分离磷酸化蛋白:
1) 使用α-Casein, from Bovine Milk, Dephosphorylated(038-23221)作为阳性对照,确认实验条
件和试剂均没有问题。
2) 可使用Phos-tag®Biotin检测样品中是否有磷酸化蛋白。确认有磷酸化蛋白后,再通过
Phos-tag ®SDS-PAGE进行分离鉴定。
3) 经质谱鉴定有表达磷酸化蛋白,建议增大样品的含量,可使用Phos-tag ®Agarose进行磷酸化蛋白
的富集。磷酸化蛋白含量过低,会影响其分离效果。
4) 文献报道有表达磷酸化蛋白,或者同源蛋白有表达磷酸化蛋白的,建议用Phos-tag® Biotin先确认
样品中是否有磷酸化蛋白。
5) 建议样品的pH值在7左右。酸性或者碱性条件下,Mn2+-Phos-tag®与磷酸化基团的特异性结合较
差。
6) 避免样品中含有高浓度的还原剂,变性剂,表面活性剂等。β-巯基乙醇浓度不高于0.2M(或者5%)。
7) 进行Phos-tag® SDS-PAGE的佳样品是纯化的蛋白。如果是细胞裂解液,体外激酶反应液,组织均
浆液等,需要摸索佳的分离胶,Phos-tag® Acylamide的浓度。建议Phos-tag® Acrylamide浓度
从50uM开始摸索。
5. Phos-tag®SDS-PAGE凝胶用于Western Blotting实验的优化建议:
1) 可以检测的样品包括体外激酶反应体系,细胞裂解液,组织均浆液。
2) 每孔样品的上样量是10~30ug(请根据蛋白表达量进行调整)
3) 制备样品中含有的还原剂、变性剂、螯合剂、钒酸等会使电泳条带发生弯曲或者拖尾。通过TCA沉淀或
渗析法降低杂质含量。
4) 建议样品的pH值在7左右。如果加入上样缓冲液后溶液显黄色或者橙色,加入Tris缓冲液调整pH值为7。
5) 目的蛋白分子量大于60kDa,分离胶的丙烯酰胺浓度为6%;目的蛋白分子量小于60kDa,分离胶的丙烯
酰胺浓度为8%。
6) 如果样品中含有大量蛋白,比如细胞裂解液,组织均浆液,Phos-tag® Acylamide浓度为5~25uM。
若目的蛋白浓度低,建议Phos-tag® Acylamide浓度为100uM。
7) Phos-tag ®SDS-PAGE凝胶用于Western Blotting实验,湿法转膜建议:10mM EDTA的转移缓冲液
处理凝胶10min,不含有EDTA的转移缓冲液处理凝胶10min。重复3次。强烈建议湿法转膜
8) Phos-tag® SDS PAGE半干法转膜建议:
i. 电泳后用含有EDTA的转移缓冲液处理凝胶,EDTA的浓度为 100mM。100mM EDTA的转移
缓冲液处理凝胶10min,不含有EDTA的转移缓冲液处理凝胶10min。重复3次。
ii. 转膜的电流值提高2%~3%, 延长时间2成。
iii. 转膜的缓冲液加SDS,加到大约0.05~0.2%,转膜效率会提高。
9) 使用目的蛋白的非磷酸化抗体即可。比如检测各种肿瘤细胞系中Src激酶活性实验,用Src的非磷酸化抗
体即可。
10) 和光的WIDE-VIEWTM Prestained Protein Siza MarkerIII(230-02461)可检测作为转膜效率,但是无
法判断分子量。
11) 一般预染的蛋白marker在Phos-tag®SDS-PAGE中条带会弯曲,无法判断蛋白分子量。
12) 不能确认磷酸化蛋白和非磷酸化蛋白的分离,请进行常规的SDS-PAGE,Western Blotting实验。比
对目的蛋白的迁移率。
13) 不能确认是因为蛋白发生磷酸化还是出现降解造成蛋白条带迁移,请进行常规的SDS-PAGE实验,确
认不会出现条带迁移。
14) 目的蛋白磷酸化与非磷酸化分离效果不佳,使用α-Casein, from Bovine Milk, Dephosphorylated
(038-23221)作为阳性对照,确认实验条件和试剂均没有问题。如果确认能够分离,调整分离胶,
Phos-tag® Acylamide的浓度。建议使用品质佳的MnCl2(139-00722)。
产品编号 | 产品名称 | 产品规格 | 产品等级 |
304-93526 | Phos-tag Acrylamide AAL-107 5mM Aqueous Solution Phos-tag 丙烯酰胺5mM水溶液 |
0.3mL | 蛋白研究 |
300-93523 | Phos-tag Acrylamide AAL-107 Phos-tag 丙烯酰胺 |
2mg | 蛋白研究 |
304-93521 | Phos-tag Acrylamide AAL-107 Phos-tag 丙烯酰胺 |
10mg | 蛋白研究 |
134-15302 | Manganese(II) Chloride Tetrahydrate氯化锰四水合物 | 25g | for Molecular Biology |